县水利局机关内设党建办公室（纪检监察室、法制股）、人秘股（督查办）、计划财务股、防汛抗旱办公室（小型水库管理所、水利工程质量监督管理站）、局河长制工作股、水生态建设办公室、建设管理股、农田水利股（农建办、综治办）、农村自来水股、水政水资源水土保持办公室（水政监察大队、行政审批股）10个股室；基层站所有三兴水库管理所(副科级单位，与锦泰灌区管理所合署办公)、罗陂水利工程管理所(副科级单位，与罗城圩堤管理所合署办公)、抗旱服务队(股级单位，与中型水库防汛安全管理站合署办公)和17个乡镇（街办）水务站。

县水利局核定行政编制10名、机关后勤编制1名；全额拨款事业编制110名（水利工程质量监督管理站16名、水政监察大队12名、小型水库管理所4名、抗旱服务队13名、锦泰灌区管理所9名、罗城圩堤管理所5名、乡镇水务站51名）；自收自支事业编制16名（三兴水库管理所10名、罗陂水利工程管理所6名）。全系统编制合计137名。

目前水利局机关行政编制人员13人，机关后勤工勤人员1人，事业编制人员30人(水利工程质量监督管理站15人、水政监察大队10人、小型水库管理所5人)，警务室3人，自聘人员9人(返聘1人、打字员1人、司机4人、实习3人)，合计56人，基层站所工作人员情况为：三兴水库管理所（锦泰灌区管理所）9人，罗陂水利工程管理所（罗城圩堤管理所）7人，抗旱服务队11人，17个乡镇（街办）水务站51人。全系统实有工作人员134人，其中专业技术人员28人(高级工程师3人、工程师8人、助理工程师17人)。